За 11 лет, прошедших с момента создания ЕГУ, университет из романтического эксперимента небольшой группы интеллектуалов, бросивших вызов консервативным традициям советской высшей школы, превратился в одного из национальных лидеров интернационализации и либерализации университетского образования в Центральной и Восточной Европе.

Идея Европейского гуманитарного университета родилась на встрече академика А. А. Михайлова, Митрополита Минского и Слуцкого Филарета и В. А. Дунаева, состоявшейся в резиденции Митрополита в 1991 г.

Окончательный образ университета был сформирован во время консультаций в секретариате ООН в Вене при активном участии Айрин Мелуп, ветерана этой организации. Позднее, в 1992 г., к инициаторам проекта присоединились в качестве учредителей Министерство образования, Министерство культуры, Национальная академия наук, Мингорисполком, Международный гуманитарный фонд, ряд крупных деятелей науки и культуры республики. Белорусский бизнес на начальном этапе оказал поддержку становлению университета (НИКА-арт, РЕСТА), но в числе учредителей сохранилось только СП «Агробелэкс».

Первым ректором ЕГУ Совет университета, в состав которого входили его учредители, избрал академика А. А. Михайлова.

Моральную поддержку проекту учреждения Европейского гуманитарного университета выразили посольства европейских стран и США ,создание ЕГУ приветствовали вице-канцлер Австрийской Республики, обер-бургомистр Вены и другие видные политические и общественные деятели.

Инициаторы проекта стремились создать новый независимый университет, который способствовал бы возрождению ценностей европейской цивилизации в нашей стране в условиях перехода от тоталитаризма к открытому гражданскому обществу.

Белорусская Православная Церковь видела задачу нового университета также в преодолении официальной атеистической идеологии, в образовании и развитии традиций христианского гуманизма как одного из фундаментальных принципов европейской культуры.

Первые международные программы в ЕГУ начали осуществляться лишь с 1993 г., когда по инициативе Посольства Франции в Минске был создан франко-белорусский факультет политических наук и проблем европейской интеграции. Большой вклад в создание этого факультета внесли посол Франции К. Жолиф, руководитель культурной службы французского посольства А. Толстой и представитель министерства иностранных дел Франции проф. И. Шемей. Во многом эта программа стала моделью для развития других международных проектов в ЕГУ.

С 1993 г. начали осуществляться программы сотрудничества с Посольством США в Беларуси, которое в тот период возглавил посол Д. Суорц, после выхода в отставку создавший в США благотворительный Фонд ЕГУ.

Совместно с немецкой библиотечной программой удалось заложить основу коллекции немецких книг в ЕГУ.

Давняя традиция сотрудничества связывает ЕГУ с российскими партнерами, прежде всего с Российской академией наук. Первое соглашение с Институтом философии РАН, возглавляемым академиком В. С. Стёпиным было подписано еще в 1993 г.

В 1994 г. университет впервые получил гранд от Института «Открытое общество» (Будапешт), предназначенный для реконструкции здания учебно-административного корпуса на пр. Франциска Скорины, 24, переданного ЕГУ в безвозмездное пользование Экзархатом Православной Церкви Беларуси. С этого момента сотрудничество ЕГУ с Институтом «Открытое общество» и в особенности с программой HESP (Программа поддержки высшего образования), приобрело устойчивый и долговременный характер.

Одним из наиболее значительных является международный проект по реструктурированию юридического образования в Беларуси, реализованный на базе факультета права ЕГУ в рамках плана трансъевропейского сотрудничества в области высшего образования (1994-1998 гг.). Сложившиеся в ходе реализации этого проекта связи ЕГУ с университетами Франции и Испании плодотворно развиваются.

В 1998 г. была начата реализация проекта по созданию в ЕГУ программы европейских исследований. Партнерами ЕГУ в рамках этого проекта стали институты политических наук Гренобля и Страсбурга (Франция),а также Тринити-колледж университета Дублина (Ирландия).

В 1995 г. в университете создан Центр американских исследований (ЦАИ), призванный содействовать интернационализации обучения и научных исследований. На базе центра создана Белорусская ассоциация американских исследований, проводятся международные студенческие и научные конференции по американистике, издается ежегодник «Американские исследования» и ежеквартальный информационный бюллетень. На базе ЦАИ реализуется программа развития дистанционной образовательной сети совместно с Университетом Саффолка (Бостон, США) и Брайант-колледжем (Провиденс, США) при поддержке Информационного агентства США.

В 1997 г. Посольство Германии в Беларуси приняло решение поддержать проект создания в ЕГУ Института немецких исследований (ИНИ). Цель проекта — содействовать развитию сотрудничества Германии и Беларуси в области образования, подготовки кадров для осуществления разнообразных проектов. На базе института в университете создаются программы подготовки специалистов по праву, экономике, германистике. Кроме того, ИНИ является организатором и участником совместных белорусско-германских научно-исследовательских и издательских проектов.

В 1997 г. в ЕГУ образован Центр гендерных исследований. Разнообразная деятельность центра — лекции, семинары, конференции, публикации, организация обменов — способствует развитию новых научных направлений в белорусском обществоведении. Деятельность Центра гендерных исследований поддерживается Фондом Макартуров.

Центр Европейских и трансатлантических исследований ЕГУ создан в 2001 г. функционирует при поддержке Европейского союза и Бюро по демократическим институтам и правам человека ОБСЕ.

В феврале 2002 г. в результате сотрудничества ЕГУ и Университета Южного Стокгольма при поддержке Шведского института был основан Центр скандинавских исследований, призванный содействовать распространению в Беларуси знаний и информации о странах Скандинавии.

Интересный опыт международного сотрудничества накоплен на факультете теологии. Активная международная деятельность этого факультета направлена на формирование и развитие единственной в СНГ университетской образовательной программы по теологии в светском вузе с учетом международного опыта и зарубежных моделей теологического и религиоведческого образования. В европейских и американских богословских институтах проходят стажировку преподаватели факультета, ряд преподавателей получил ученые степени в зарубежных университетах. Для работы на факультете приглашаются преподаватели теологи из России, Италии, Германии, Швейцарии, и других стран.

Европейский гуманитарный университет наладил хорошие рабочие контакты со многими посольствами иностранных государств, представителями международных организаций в Беларуси. Ряд посольств, например, США, Франции, Германии, Польши, Италии, Греции, Турции, активно поддерживают реализацию долговременных программ сотрудничества университета с партнерами из этих стран.